حضرت محمد (ص) در حال بازگشت از طائف، پس از طى مسيرى طولانى با قلبى شكسته در مكان اين مسجد كه به نخله معروف بود، كنار نخل خرمايى نشست و نيمه شب به عبادت و تلاوت قرآن پرداخت.
اين مكان در حجون و دامنه شعب ابى دب قرار داشت. بعدها به ياد آن حادثه بزرگ، مسجدى ساخته و آن را «مسجد جن» ناميدند.