یکی از اقداماتی که به تازگی در این موسسه اجرا می‌شود، برگزاری آزمون‌های سه مرحله‌ای برای حافظان کل قرآن است که به هر دلیلی نتوانستند خود را به مرحله کشوری آزمون "ترنم وحی97" برسانند.
سید محمود چاوشی مدیر عامل مؤسسه کشوری مهد قرآن در تشریح راهبرد جدید برای آن دسته از حافظان کل که قادر به ارایه تمامی محفوظات خود در یک مرحله نیستند و این امر باعث کم‌انگیزگی و بعضاً عدم استمرار و تثبیت حفظ ایشان می‌شود، تصریح کرد: با تصمیم هیات علمی مؤسسه به ریاست استاد شهریار پرهیزکار برای حمایت از این سرمایه های ملی (حافظان کل) مقرر شد که آزمون سه مرحله‌ای حفظ کل با انجام زمان‌بندی طی سه مرحله جداگانه (هر 10 جزء) به صورت آنلاین توسط معاونت آموزش دفتر مرکزی انجام پذیرد.
مدیر عامل مؤسسه مهد قرآن در مورد مشمولان شرکت در آزمون سه مرحله‌ای یادآور شد: آن دسته از حافظان کل قرآن که در مرحله آزمون مقدماتی "ترنم وحی97" حد نصاب نمره قبولی را جهت حضور در مرحله کشوری کسب نکرده و یا در مرحله کشوری قبول نشدند با انجام ثبت‌نام، طی ماه‌های آذر، دی و بهمن‌ماه سال جاری می‌توانند در آزمون سه مرحله شرکت کنند.
قبول‌شدگان در آزمون سه مرحله‌ای، گواهینامه و هدیه خود را متفاوت با آزمون "ترنم وحی" (یک مرحله‌ای) دریافت خواهند کرد.